Wie kann man in R einen gepaarten t test machen? 
Das funktioniert über den Befehl t.test mit den folgenden Einstellungen:
t.test(X,Y,paired=TRUE,alternative="two.sided")
Mit 
paired=TRUE signalisierst Du R, dass es sich um abhängige Stichproben handelt. Der Test kann auch einseitig (
greater oder 
less) sein. Mit 
alternative="two.sided" ist ein zweiseitiger t\(-\)Test gemeint.